Wieś Cząstkowice istniała już w połowie XIV wieku . W 1658 roku wieś liczyła 5 łanów roli, mieszkało 6 zagrodników nie posiadających roli i jeden z rolą, oraz 6 komorników i jeden komornik z bydłem.
W 1658 roku zagospodarowane były 2 łany roli, mieszkał jeden komornik i jeden komornik z bydłem, który uprawiał aż pół łana roli. Nie uprawiano 3 łanów roli (leżała odłogiem), zniszczona została karczma, a podatków nie płaciło 6 zagrodników.
W 1713 roku Kmieci tygodniowych jest 3. Zagrodników ćwierciowych trzydniowych jest 15, karczma na ćwierci. Pole próchnica i rędzina czarna.
W 1902 roku miały 63 domy, a we wsi mieszkało 336 osób. W tym obszar dworski liczył 8 domów mieszkało w nich 70 osób, a przełożonym był Józef Łoziński.
Dzieci chodziły do szkoły publicznej jedno klasowej do Czudowic, która założona została w 1902 r .
Parafia rzymsko katolicka była w Rudołowicach, natomiast w Pełnatyczach  grekokatolicka.

Cząstkowice istniały już w XV w. i stanowiły wówczas własność Mikołaja Ptaczka z Jankowic . W 1890 r. właścicielem dóbr tabularnych (gruntów szlacheckich) w Cząstkowicach był hrabia Włodzimierz Dzieduszycki, a po nim hrabia Tadeusz Dzieduszycki . Według powszechnego spisu ludności przeprowadzonego 30 września 1921 r. liczba ludności Cząstkowic wynosiła 486 osób z czego 172 były wyznania rzymskokatolickiego, 300 było wyznania greckokatolickiego, a 14 wyznania mojżeszowego.  We wsi zatem przed II wojną światową przeważali grekokatolicy, którzy uczęszczali do cerkwi w Pełnatyczach

W latach 1975-1998 miejscowość administracyjnie należała do województwa przemyskiego.